Afin de s’adapter aux spécificités régionales, le Secrétaire Général du CIMM a créé des groupes de travail régionaux (GTR). Les pays membres géographiquement proches peuvent adhérer à un ou plusieurs GTR sur une base volontaire. Les activités des groupes de travail régionaux sont spécifiquement orientées vers des questions scientifiques et techniques communes.
Les Commissions Techniques (CT) représentent les différentes métiers de la santé militaire. Elles développent les aspects spécifiques liées à l’exercice de ces professions dans le contexte des Forces Armées.
Le Centre de référence pour l’enseignement du Droit International Humanitaire et de l’Ethique est mandaté par le Comité International de Médecine Militaire (CIMM), et son Directeur est élu par l’Assemblée Générale. La direction coopère étroitement avec le Conseil Scientifique du CIMM.